Evola  Search ortholog by   Keyword   (Human) Accession number   (All species) Gene symbol   (Human)              (  All species Chimpanzee Macaque Mouse Rat Dog Horse Cow Opossum Chicken Zebrafish Medaka Tetraodon Fugu with   All annotation status Manual curation  )

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↑ 検索例：lung cancer (Keyword)、AB002303, ENST00000338008, NM_173392 (Accession number)、RHEB (Gene symbol)

Evolaとは     Evola (http://www.h-invitational.jp/evola/) はH-InvDBのヒト遺伝子について他の脊椎動物とのオーソログ情報を格納しています。オーソログ（オルソログ、ortholog）は共通祖先遺伝子から種分化によって生じた遺伝子です。Evolaでは比較ゲノム解析およびアミノ酸配列の相同性解析にもとづいて同定されたオーソログ(Computational analysis)を提供しています。系統樹解析によって遺伝子と生物種の系統関係が一致したオーソログ(Manual curation)も提供しています。また、遺伝子ファミリーごとにオーソログとパラログ（paralog、重複によって生じた遺伝子）を種間比較することも可能です。[ Sample1, Sample2 ]     Evolaは無償でご利用いただけます。ご利用の際には下記論文の引用をお願いします。     Matsuya A, Sakate R, Kawahara Y, et al. Nucleic Acids Res. 2008; 36: D787-92.

更新情報 [16-Oct-2009] 系統樹表示ツール（ATV）が、直前に表示した系統樹を再度表示してしまうことがあるのを修正。 [11-Aug-2009] ヘルプページを更新しました。 [27-Apr-2009] アラインメントおよび系統樹でRefSeq XR配列のパラログフラグ（末尾の"_"）が誤っていたケースを修正しました。 [30-Mar-2009] Evola release 6.0: ４生物更新(Mouse, Cow, Horse, Zebrafish)。スプライシングバリアントのオーソログ判定を追加。 [30-Sep-2008] ダウンロードページをEvola release 5.1に完全に対応。 [30-Apr-2008] Evola release 5.1: プログラムのバグ修正に伴うオーソログデータの一部修正。 [26-Dec-2007] Evola release 5.0: アルゴリズム改良および新規データによる更新。ウマとメダカの追加。Gene family view（ベータ版）の公開。 [27-Sep-2007] Manual curation情報の更新。NJ/NJML+系統樹の更新。 [27-Jun-2007] Evola release 4.1: オーソログ同定アルゴリズム改良によるデータ更新。 [24-May-2007] dN/dS view更新。 [30-Mar-2007] Evola release 4.0: 生物種の追加（他生物：4->12種）。Computational analysisオーソログの公開。 [28-Sep-2006] Evola release 3.1: Manually curationオーソログとComputational analysisオーソログの公開。 [23-Jun-2006] Evola release 2.1: H-InvDB 3.4でのヒト代表配列の更新によるデータ更新。 [19-May-2006] NJ/NJML+系統樹の追加。 [31-Mar-2006] Evola release 2.0: Computational analysisオーソログの公開。 [31-Aug-2005] Evola正式版の公開。

Evola 6.0 統計情報 Species Genes* Human genes* Human  hg18 22,496 - Chimpanzee  panTro2 19,442 19,663 Macaque  rheMac2 17,507 17,739 Mouse  mm9 17,540 17,831 Rat  rn4 16,110 16,453 Species Genes* Human genes* Dog  canFam2 16,588 17,006 Horse  equCab1 15,998 16,359 Cow  bosTau4 15,348 15,642 Opossum  monDom4 12,083 12,342 Chicken  galGal3 11,567 12,112 Species Genes* Human genes* Zebrafish  danRer5 14,165 13,262 Medaka  oryLat1 12,683 12,359 Tetraodon  tetNig1 11,807 11,575 Fugu  fr2 12,710 12,455

* 「１対１」オーソログに加えて、「１対多」や「多対多」オーソログが含まれることがあるため、"Genes"と"Human genes"の数は異なります。

Hedges and Kumar 2002 (modified)

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関連サイト - G-compass: Comparative genome browser